Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX43Q9NXZ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms