Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDKN2AIPQ9NXV6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2AIPQ9NXV6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms