Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A12Q9NXJ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A12Q9NXJ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms