Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKS1Q9NXB0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKS1Q9NXB0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms