Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms