Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZCCHC3Q9NUD5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms