Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms