Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA4L2Q9NRX3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms