Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CCL28Q9NRJ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL28Q9NRJ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms