Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms