Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A2Q9NQ11 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A2Q9NQ11 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms