Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms