Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms