Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms