Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UPF2Q9HAU5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF2Q9HAU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms