Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVMER34-1Q9H9K5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVMER34-1Q9H9K5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms