Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCQ9H7C4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms