Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG1Q9H6L5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.4 ms