Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TAF1DQ9H5J8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF1DQ9H5J8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1DQ9H5J8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms