Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM12Q9H4Q4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms