Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1DNQ9H478 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1DNQ9H478 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1DNQ9H478 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1DNQ9H478 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1DNQ9H478 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1DNQ9H478 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1DNQ9H478 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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