Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A8Q9C0K1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms