Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP4Q9C0A0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms