Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms