Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM6Q9C030 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms