Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRNKL1Q9BZJ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRNKL1Q9BZJ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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