Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM55Q9BYV6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms