Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC3Q9BY71 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms