Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms