Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC11CQ9BY50 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms