Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms