Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
RNF17Q9BXT8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF17Q9BXT8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms