Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms