Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD2AQ9BW72 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms