Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms