Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms