Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KATNB1Q9BVA0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms