Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP8Q9BV40 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms