Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms