Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKNK1Q9BUB5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKNK1Q9BUB5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms