Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms