Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.8 ms