Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms