Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2AQ9BSW2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2AQ9BSW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms