Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms