Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDHD3Q9BSH5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDHD3Q9BSH5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms