Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms