Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA1CQ9BQE3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms