Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSG101Q99816 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSG101Q99816 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms