Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRQ99707 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRQ99707 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRQ99707 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRQ99707 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRQ99707 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRQ99707 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRQ99707 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRQ99707 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRQ99707 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRQ99707 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRQ99707 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRQ99707 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTRQ99707 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTRQ99707 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRQ99707 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRQ99707 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms